Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdc27A2A6Q5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc27A2A6Q5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms