Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc194A0A140LIT1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc194A0A140LIT1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc194A0A140LIT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc194A0A140LIT1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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