Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Znf728Q6P5C7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf728Q6P5C7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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