Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trip6Q9Z1Y4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip6Q9Z1Y4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms