Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VarsQ9Z1Q9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VarsQ9Z1Q9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VarsQ9Z1Q9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms