Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nup160Q9Z0W3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Nup160Q9Z0W3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nup160Q9Z0W3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Nup160Q9Z0W3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.9 ms