Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stub1Q9WUD1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stub1Q9WUD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stub1Q9WUD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms