Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phf2Q9WTU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf2Q9WTU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf2Q9WTU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf2Q9WTU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms