Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ggps1Q9WTN0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ggps1Q9WTN0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ggps1Q9WTN0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggps1Q9WTN0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms