Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma4Q9R1P0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma4Q9R1P0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms