Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cry2Q9R194 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cry2Q9R194 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms