Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna6Q9R0W9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna6Q9R0W9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna6Q9R0W9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna6Q9R0W9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chrna6Q9R0W9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chrna6Q9R0W9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna6Q9R0W9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms