Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zeb2Q9R0G7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb2Q9R0G7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zeb2Q9R0G7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zeb2Q9R0G7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.7 ms