Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vav3Q9R0C8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vav3Q9R0C8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vav3Q9R0C8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms