Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a4Q9QZR9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a4Q9QZR9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a4Q9QZR9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms