Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc1Q9QZF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc1Q9QZF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc1Q9QZF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.9 ms