Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Six6Q9QZ28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Six6Q9QZ28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Six6Q9QZ28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms