Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cbx8Q9QXV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx8Q9QXV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx8Q9QXV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms