Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad18Q9QXK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad18Q9QXK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms