Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limd1Q9QXD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limd1Q9QXD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limd1Q9QXD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms