Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tcea2Q9QVN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tcea2Q9QVN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms