Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rabgef1Q9JM13 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rabgef1Q9JM13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabgef1Q9JM13 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms