Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacng4Q9JJV4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng4Q9JJV4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng4Q9JJV4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms