Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms