Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Riox1Q9JJF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Riox1Q9JJF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1415.7 ms