Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RabggtaQ9JHK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms