Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ush1cQ9ES64 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ush1cQ9ES64 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms