Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cse1lQ9ERK4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cse1lQ9ERK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cse1lQ9ERK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms