Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms