Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab13Q9DD03 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rab13Q9DD03 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rab13Q9DD03 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab13Q9DD03 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms