Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
March8Q9DBD2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
March8Q9DBD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March8Q9DBD2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March8Q9DBD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms