Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf4Q9DAW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms