Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift43Q9DA69 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift43Q9DA69 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift43Q9DA69 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms