Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700123K08RikQ9D991 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700123K08RikQ9D991 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700123K08RikQ9D991 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms