Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifrd2Q9D8U0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms