Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8Q6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 698 ms