Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl4Q9D8E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl4Q9D8E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl4Q9D8E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms