Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fip1l1Q9D824 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fip1l1Q9D824 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fip1l1Q9D824 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fip1l1Q9D824 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms