Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm5Q9D806 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm5Q9D806 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms