Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Med8Q9D7W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med8Q9D7W5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med8Q9D7W5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms