Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan17Q9D7W4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tspan17Q9D7W4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan17Q9D7W4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms