Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmigd1Q9D7L8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmigd1Q9D7L8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmigd1Q9D7L8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmigd1Q9D7L8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms