Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf225Q9D7D1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf225Q9D7D1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf225Q9D7D1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms