Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tube1Q9D6T1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tube1Q9D6T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tube1Q9D6T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms