Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc94Q9D6J3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc94Q9D6J3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms