Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptp4a3Q9D658 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptp4a3Q9D658 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms