Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D5Q8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D5Q8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D5Q8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms