Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D4W2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D4W2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D4W2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D4W2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D4W2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D4W2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D4W2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D4W2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms