Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Phf6Q9D4J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf6Q9D4J7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf6Q9D4J7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf6Q9D4J7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.3 ms