Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Efhd1Q9D4J1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efhd1Q9D4J1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efhd1Q9D4J1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Efhd1Q9D4J1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms